1、 EdU标记细胞 (即细胞DNA合成时掺入EdU)和(可选)标记细胞表面抗体
1.1 培养细胞,于每mL新更换的新鲜培养基中加入1.0µL组份A,使EdU终浓度达10μM。
(注:该浓度仅供参考,标记效果受细胞密度、类型、培养基种类等因素影响,最好预试验确定合适宜的EdU,终浓度一般为1-10μM或参考附表1-2,如果提高浓度,则缩短下步的孵育时间;阴性对照不加EdU,如为血液样本,采血时需用肝素抗凝。)
1.2 细胞继续培养按原条件培养孵育1-2h;
(注: 孵育时间取决于细胞生长速率,可预试验确定或参考附表1);
1.3 (可选)标记细胞表面抗体:每107个细胞加3mL含1%BSA的PBS洗二遍后,加1mL重悬,取100µL(106个)与标记抗体混合,按抗体标记说明书并避光操作
(注:在第3步click反应标记荧光素之前,不可使用PE, PE-连接物, 或量子点 抗体偶联物,尽快进行2.1步固定细胞)
2、细胞固定及促渗
2.1 细胞加3mL的1%BSA in PBS洗一遍,离心弃上清,于沉淀中加入100µL组份C,室温避光固定15 min;
2.2 离心弃上清,于细胞沉淀中加3mL含1%BSA的PBS洗一遍;
2.3 离心弃上清,于细胞沉淀中加入100 µL的 1×组份D(组份D用1%BSA in PBS 稀释10倍即得)通透,室温避光孵育15 min或直接进行3.1步的Click反应;
3、Click反应,使DNA-EdU标记上荧光素
3.1 配制Click Buffer 添加物
组份简称
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组份全称
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配制方法
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10×组份F
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10×Click Buffer 添加物
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每200mg组份F加1mLdH2O溶解,保存于-20℃ 1年,如变棕色失效。
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1×组份F
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1×Click Buffer 添加物
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10×组份F以dH2O稀释成1×组份F,即用即配。
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3.2 配制Click反应液 (务必按下表的顺序依次添加各组份)
反应组份
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反应数
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1
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2
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5
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10
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15
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25
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50
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100
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PBS, D-PBS, or TBS
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438µL
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875µL
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2.19mL
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4.38mL
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6.57mL
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10.95mL
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21.9mL
|
43.8mL
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组份C: CuSO4
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10µL
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20µL
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50µL
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100µL
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150µL
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250 µL
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500 µL
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1mL
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组份B :叠氮荧光素647
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2.5µL
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5µL
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12.5µL
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25µL
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37.5µL
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62.5 µL
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125µL
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250 µL
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1×组份F:1X Click Buffer 添加物
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50µL
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100µL
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250µL
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500µL L
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750µL
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1.25mL
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2.5mL
|
5mL
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总体积
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500µL
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1mL
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2.5mL
|
5mL
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7.5mL
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12.5mL
|
25mL
|
50mL
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3.3 细胞弃通透洗涤液,每管加上述配好的 0.5mL Click反应液并摇匀,室温避光孵育30min;
3.4 离心弃Click反应液,每管加3mL1×通透洗涤液(1×组份D)洗1次;
3.5 细胞沉淀, 选择如下操作:
加500µL 1×通透洗涤液重悬,直接上流式细胞仪(步骤 6)检测,
或加100µL 1×通透洗涤液重悬,选择4.1-4.4 (抗体标记细胞内或表面抗原)、
或加500µL 1×通透洗涤液重悬,选择5.1-5.2(检测细胞DNA含量)
4、(可选) 同时用抗体标记细胞内或表面抗原
4.1 加抗胞内或表面抗原的荧光蛋白(RPE、PE-连接或量子点)偶联抗体,混匀;
4.2 按抗体说明书要求的时间和温度,避光孵育,
4.3 每管加3mL的1×通透洗涤液洗一遍,离心弃上清,
4.4 细胞沉淀,选择如下操作:
加500µL 1×通透洗涤液重悬,直接上流式细胞仪(步骤 6)检测,
或加500µL 1×通透洗涤液重悬,选择5.1-5.2(检测细胞DNA含量)
5、(可选)同时检测细胞DNA含量
5.1 每管加入SYTOX核DNA染料和RNA酶(按细胞核或细胞周期染料说明书操作);
5.2 参考细胞核染料说明书,避光孵育10-15min;
6、 流式细胞仪分析
EdU-F647 激发633/635nm,发射波长660/20nm ,
核DNA染料和流式抗体的荧光光谱请参考相关产品说明书。传统流式细胞仪上检测总DNA 含量,收集过程中需使用低流速。DNA含量的染料荧光信号以线性放大方式检测,而Click标记EdU生成的荧光信号最好通过对数放大方式来检测。

图2: EdU-F647单染 检测增殖细胞 图3:EdU-F647/SYTOX 双染检测DNA含量并区分细胞周期
附: EdU和BrdU 双标法检测细胞增殖的策略
按如下策略用 EdU 与 BrdU 对培养细胞进行双标:
• 用 EdU 进行首轮标记, BrdU 用于第二轮标记。
• 用 BrdU 进行第二轮标记时,不需要从细胞培养基中去除 EdU。
• EdU和 BrdU同时存在时 ,BrdU优先掺入 DNA合成,而 EdU不会
同时掺入, 此特点简化了双标记时通常需要洗涤去除前一标记物的步骤,。
• 在采用验证过的 BrdU 标记方法进行二轮标记后再处理细胞。
• 在 BrdU标记时的 DNA 变性步骤之后,首先进行click反应以标记EdU,
然后按抗体标记方法检测BrdU。
• 选择对 EDU 没有交叉反应的 BrdU 抗体。

图4: EdU和BrdU 双标检测细胞增殖
附表:
表1 EdU孵育时间设定参考
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细胞系
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人胚胎细胞
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酵母细胞
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人成纤维细胞
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人宫颈癌细胞
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人胚肾细胞系
|
人神经细胞
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细胞周期
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~30min
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~3h
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~18h
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~21h
|
~25h
|
~5d
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孵育时间
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5min
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20min
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2h
|
2h
|
2h
|
1d
|
表2 细胞实验EdU孵育浓度及时间参考
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PubMed ID
|
Reference
|
Cell line
|
Concentration
|
Time
|
18272492
|
Salic A, et al. PNAS. 2008
|
NIH3T3, Hela
|
10 nM~10 μM
|
1 hr
|
18521918
|
Cappella P,et al. Cytometry A. 2008
|
HL-60, A2780, U2OS
|
1~10 μM
|
30 min
|
18996411
|
Chehrehasa F, et al. J Neurosci Methods. 2009
|
Neurospheres
|
1~20 μM
|
24 hr
|
19179371
|
Limsirichaikul S, et al. Nucleic Acids Res. 2009
|
Primary fibroblasts
|
10 μM
|
1,2,4 hr
|
19253396
|
Warren M, et al. Dev Dyn. 2009
|
Chick embryos
|
10 μM~2 mM
|
4 hr
|
19647746
|
Yu Y, et al. J Immunol Methods. 2009
|
Spleen cells
|
50 μM
|
24 hr
|
19544417
|
Momcilović O, et al. Stem Cells. 2009
|
Human ES cells
|
10 μM
|
30 min
|
20080700
|
Cinquin O, et al. PNAS. 2010
|
emb-30
|
1 μM
|
12 hr
|
20025889
|
Han W, et al. Life Sci. 2009
|
VSMC
|
50 μM
|
2 hr
|
20659708
|
Huang C, et al. J Genet Genomics. 2010
|
ESC
|
50 μM
|
2 hr
|
21310713
|
Hua H, et al. Nucleic Acids Res. 2011
|
fission yeast strains
|
10 μM
|
3 hr
|
20824490
|
Lv L, et al. Mol Cell Biochem. 2011
|
EJ cells
|
50 μM
|
4hr
|
21248284
|
Yang S, et al. Biol Reprod. 2011
|
GC cells
|
50 μM
|
2 hr
|
21227924
|
Zhang YW, et al. Nucleic Acids Res. 2011
|
U2OS, HT29
|
30 μM
|
90 min
|
21829621
|
Guo T, et al. PloS One. 2011
|
HIT-T15
|
50 μM
|
4hr
|
21980430
|
Zeng T, et al. PloS One. 2011
|
MCF-10A
|
25 μM
|
2hr
|
22012572
|
Ding D, et al. Int Orthop. 2011
|
C3H10T1/2
|
10 μM
|
24hr
|
22000787
|
Zeng W, et al. Biomaterials. 2011
|
EPC
|
50 μM
|
4hr
|
21913215
|
Xue Z, et al. J Cell Biochem. 2011
|
SGC7901
|
25 μM
|
24hr
|
22016038
|
Peng F, et al. Lasers Med Sci. 2011
|
MSC
|
50 μM
|
2hr
|
21878637
|
Li D, et al. J Biol Chem. 2011
|
HCC
|
50 μM
|
2hr
|